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 3,4階の循環器病棟は、これまでの循環器内科と心臓血管外科の壁を取り払った、合同の循環器病棟となります。これにより内科と外科の連携が一層円滑になり、診療の質が向上し、さらに入院当初から内科外科の両科で診療に当たれるため、術前・術後の外科・内科のあいだの引き継ぎも適切に行え るようになります。しかも、患者様は転科しても転棟しないため、看護体制も変わらず、前担当医が同一病棟にいるため転科による患者様の不安感、緊張感を極めて軽減できます。病床数は3階39床（重症の患者様）、4階31床（軽症の患者様）の合計70床です。さらに、各部屋にはそれぞれのトイレ、シャワーを配置し、患者スペースも従来の病棟より大きくとってあります。
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全16室が全ての手術に対応できる設計になっています。ナビゲーション手術や鏡視下手術などの高度先進技術を考慮して、これらの目的に特化した手術室を設けています。中でも30インチモニターを設置した鏡視下手術専門の3手術室は、我が国でトップクラスの装備を備えています。
まま手術部内に入室出来るという１足制の取り入れ、全室にシーリングペンダントを導入し床上にガス管や電気配線を這わせない運用とするほか、手術オーダシステム、麻酔生体情報システム、画像活用のための情報・通信システム、鋼製小物のコンテナーシステム、手術毎のケースカートシステムなどを導入し、手術の安全性を高めるほか、大学病院としての外科教育分野に大きく貢献できると期待しています。 
大手術後の患者や重症患者の集中的な治療を行うICUは、今まで本院に6床ありましたが、中央病棟ではICUを18床に増加しました。設備面も充実し、急性期患者の治療が一層安全に行えるようになります。
5階のOncology病棟は、総病床数25床、うち環境のクリーン度が高いクラス100の個室3室、クラス10000
個室4室で、本院における癌化学療法のICUとしての役割を果たします。この病棟は全ての診療科の共同利用とし、癌化学療法を専門とした診療科のほか、症例数の比較的少ない診療科の癌化学療法についても対応します。
地階には、臨床病理部と材料部が設置されます。臨床病理部と手術部が近接することで、術中迅速診断がさらに迅速・的確に行われるようになります。また、材料部では、職業感染の防止を目的に現場での一次洗浄を廃止し、病棟・外来・手術部で使用した再使用可能器具の洗浄・消毒・滅菌を中央化します。
ICU,3,4,5階の中央部分は、医師、看護師、その他の医療従事者全員が共同で作業出来るスタッフステーションを配置し、チーム医療が行いやすい環境を整えました。
