顕微鏡写真は実験データの提示法として説得力があるが、近年では単に画像を示すだけでなく、染色強度や陽性細胞数などを数値化することで定量的に評価すること、多数の画像データを統計学的に処理することが求められることが多い。これは画像解析の手法によって可能になる。無料で利用できる画像解析ソフトImageJを利用して、基本的な画像解析を行う上で必要となるテクニックや、画像解析結果を対象に統計処理を行う上での注意点について解説する。また、実際の解析処理でよく遭遇するトラブルの回避法等について説明する。